Durante a década de 2000, Minas e Cimed/Florianópolis dominaram o cenário da Superliga Masculina. Na primeira metade dos anos 2000, o Minas conquistou dois títulos da competição. Na sequência do período, o Minas ainda foi finalista por cinco temporadas consecutivas, sendo campeão em 2006/2007. Por sinal, sua última conquista de Superliga Masculina. Foi justamente nessa época que o Minas começou a perder a supremacia na história da competição.
A partir da temporada de 2005/2006, o Minas ganhou um rival à altura no torneio. Um novo projeto surgiu no sul do Brasil, na esteira do fim das equipes patrocinadas por universidades da região. Sob o comando técnico de Renan Dal Zotto, o Cimed/Florianópolis chegou forte na disputa do título da Superliga Masculina, já na primeira temporada de sua história. O time de Santa Catarina conquistou 4 títulos da Superliga Masculina, sendo que em três deles, o Minas foi o seu rival na finalíssima da competição.
Em seu começo, o projeto do Florianópolis aproveitou o êxodo de jogadores da seleção brasileira para Europa, apostando em uma nova geração, que viria a ser campeã olímpica nos Jogos do Rio 2016. Foi nessa época, que o entrosamento entre Bruninho e Lucão atingiu a sintonia fina vista por todos na seleção brasileira. Com a crise econômica mundial de 2008, vários jogadores brasileiros retornaram do exterior, fortalecendo a Superliga. Mais uma vez, o Florianópolis soube aproveitar a oportunidade no mercado contratando grandes estrelas como Giba e Gustavo, mudando o perfil do seu projeto.
Enquanto isso, o Minas se apoiava muito no trio Ezinho, Roberto Minuzzi e Samuel. Os três atacantes defendiam a camisa do Minas como poucos. O desempenho deles na Superliga levou os três jogadores para seleção brasileira. Mas infelizmente, nenhum dos três conseguiu vingar com a camisa do Brasil. Ezinho pela baixa estatura, Roberto Minuzzi por problemas cardíacos e Samuel com lesão no ombro que praticamente o tirou da prática da modalidade em alto nível. Samuel ainda fez parte da delegação brasileira nos Jogos de Pequim 2008, sendo medalhista de prata, mas dali em diante, devido ao problema no ombro, nunca mais conseguiu recuperar o seu rendimento. Posteriormente, com o retorno de André Heller e André Nascimento, o Minas foi superado pela segunda vez consecutiva pelo Florianópolis na Superliga em uma decisão.
No fim das contas, o Florianópolis venceu o Minas nas finais da Superliga Masculina por três temporadas. O Minas, como dito acima, venceu uma vez. O Florianópolis ainda conquistou mais um título de Superliga, na temporada 2009/2010, contra o Montes Claros, encerrando o ciclo da década sob vantagem de títulos contra o seu principal rival, Minas, por 4×3. No link abaixo, você acessa a última final de Superliga Masculina entre Minas e Florianópolis na temporada 2008/2009.
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